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Accueil > Les trimestres > Automne 2015 > Séminaire « Informatique Scientifique de Besançon » > Programme > T3 > Génomique haut-débit en environnement-santé

Génomique haut-débit en environnement-santé

Orateur(s)
Benoît Valot (Laboratoire Chrono-environnement)

Résumé
L’essor des techniques de séquençage haut-débit a permis un bond dans le domaine de la génomique. Néanmoins, elles ont également apporté de nouveaux problèmes en terme de traitement.
Le séquençage va produire des millions de lectures de courtes séquences d’ADN (<300pb). Suivant les applications, l’analyse de ces données va demander des capacités de calculs très différentes (mémoire vive, tableau de taches, ...)
Durant cet exposé, je présenterais les applications en génomique haut-débit du laboratoire Chrono-Environnement et leurs spécificités en terme de traitements informatique et statistique.

Durée
20 minutes

Support

PDF - 2.3 Mo